с 1 декабря 1940 г. начала функционировать Школа летчиков-истребителей.

Январь 1941 г. Школе присвоено наименование Армавирской военной авиационной школы пилотов

В октябре 1945 года Армавирская военная авиационная школа пилотов получила наименование «Армавирское военное авиационное училище летчиков».

В марте 1960 года авиаучилище было преобразовано в высшее. В то же время произошло переподчинение его из Военно-Воздушных Сил в состав Войск противовоздушной обороны.

1980 году оно было переподчинено Главкому ВВС, а с марта 1986 года вновь возвращено в состав Войск ПВО.

Постановлением Совета Министров СССР от 19 февраля 1985 года в целях увековечения памяти Главного маршала авиации Кутахова П.С., Армавирскому ВВАКУЛ присвоено его имя.

Постановлением Правительства РФ от 29 августа 1998 года № 1009 образован Армавирский военный авиационный институт путем слияния  Качинского высшего военного авиационного училища лётчиков им. А.Ф. Мясникова  и Армавирского высшего военного авиационного училища лётчиков им. Главного маршала авиации Кутахова П.С.

Постановлением Правительства РФ от 11 ноября 2002 г. № 807 Армавирский военный авиационный институт и Балашовский военный авиационный институт реорганизованы путем присоединения их к Краснодарскому военному авиационному институту имени Героя Советского Союза А.К. Серова в качестве структурных подразделений.

  В 1968 году   Армавирское высшее военное авиационное училище летчиков ПВО награждено орденом Красного Знамени.